申論 1Watson 和Crick 解開DNA 三維結構後，開啟科學家探討DNA 本質，你的工作發現獲得以下資訊，試問你如何解讀？㈠某疾病基因有一自然產生寡聚核苷酸（oligonucleotides），序列是迴紋的構造（palindromic），其中一股為TGATGTCCATGGACATCG，請繪出這構造形成雙髮夾或十字形的可能構象？並指出十字形的對稱中心。（4 分）㈡從病毒分離出一段DNA 基因組，熔離實驗（melting analysis）發現僅有10％減色（hypochromicity），請說明為何偏低。（4 分）㈢溴化乙錠（ethidium bromide）是一個平面染料分子，做為DNA 分子染色的機制為何？當加入乙錠到負超螺旋DNA 分子，在電泳過程中發現DNA 移動速率變慢，若繼續加，為何DNA 分子移動速率變快回到原來速率？（8 分）㈣說明為何DNA 在鹼性環境（0.3M KOH）是安定的，但RNA 會被分解成2-或3-nucleoside monophosphates。（4 分）
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弱點分析
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申論 2植物經基因工程改造以表達綠色螢光蛋白質（green fluorescent protein），生長在普通的園土，正常澆水，將會在黑暗中發光；而基因改造以表達螢火蟲螢光素酶（firefly luciferase）的植物，卻不會在黑暗中發光。請說明為甚麼？（10 分）
申論 3你是第一位發現了牛樟芝有一種新蛋白質X 的研究員。設計一個酵母菌的雙雜交實驗（yeast two-hybrid analysis），以確定新蛋白質X 與其他真菌細胞中的蛋白質相互作用，並解釋這個結果如何可以幫助你確定新蛋白質X 的功能。（10 分）
申論 42013 年3 月禽流感A 型H7N9 病毒被確認感染人類，研究人員取樣3 個咽喉拭子標本，利用自行設計特異性引子和探針（primers & probes）組合，檢測H1 到H16 和N1 到N9 亞型，又利用總共有198 個引子來擴增全基因組進行測序。㈠請問這個病毒樣本是檢驗何種物質？H 與N 各代表何種指標分子？（8 分）㈡詳細說明利用PCR、RT-PCR、real-time RT-PCR 技術，如何完成檢測H7N9 亞型、擴增基因組、測序的工作。（12 分）
申論 5玉米利用酵素轉化物質成為有價值的工業產品的成功例子，玉米經高壓蒸氣處理，冷卻後加入β-澱粉酶及葡萄糖澱粉酶水解生成葡萄糖，最後被葡萄糖異化酶轉化成果糖，成為高果糖玉米糖漿。已知運動發酵單胞菌（Zymomonas_mobilis）可以進行糖解（Entner-Doudoroff Pathway）產生酒精。請提出一適當的微生物代謝途徑，利用重組DNA 技術，最有效生物技術應用於玉米發酵成酒精。（10 分）
申論 6疫苗用來增加抵抗力，預防傳染病。傳統疫苗是使用減毒或已死微生物，來激發免疫反應。重組DNA 技術已經開發出新一代疫苗，請說明何謂抗原疫苗（antigen-only vaccine）、DNA 疫苗、HIV 疫苗、食用疫苗（edible vaccine）。（15 分）
申論 7請說明對於重組DNA 發展很重要的亞斯洛馬研討會（Asilomar Conference）的結論為何？針對基因重組的物理性污染防範，我國對操作實驗室訂有那幾等級，其防護要求為何？（15 分）