申論 1最近德國某一生機農場所出產的豆芽菜遭到大腸桿菌污染，成了奪命元凶，導致歐洲的大規模疫情。但事件剛開始時曾誤以為黃瓜才是導致疫情的污染源。試以上述事件為例，回答下列問題的生物技術方法流程，並說明這些方法之原理、實驗過程與判讀方式。（20 分）㈠檢測食品或農作物（黃瓜或豆芽菜）是否遭受指標性致病菌污染？㈡分離遭受污染之食品或農作物的致病菌菌株。㈢鑑定遭受污染之食品或農作物的致病菌種（大腸桿菌）。
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申論 2最近「食品起雲劑因違法添加環境荷爾蒙塑化劑」而造成食品污染的重大事件，引起嚴重的食品安全問題。假設長期暴露在大量的環境荷爾蒙下，可能會影響肝臟細胞正常運作而導致癌症，試回答下列問題：（20 分）㈠何謂環境荷爾蒙（environmental hormone）？㈡今欲以細胞實驗證明環境荷爾蒙的長期暴露可能導致肝癌的假設。試述該實驗所需的材料、實驗步驟過程與其結果判讀方式。㈢今欲進一步以動物實驗證明上述細胞實驗中，環境荷爾蒙的長期暴露可能導致肝癌的結果。試述該實驗所需的材料、實驗步驟過程與其結果判讀方式。
申論 3科學家發現一新穎之人類基因序列A。經生物資訊序列分析，預測該基因產物（以下簡稱A 蛋白）可能是新型的激酶（kinase）。試說明利用那些生物技術方法可鑑定A 基因之下列特性，並說明這些方法之原理、實驗過程與判讀方式。（20 分）㈠會表現A 基因的器官組織。㈡A 蛋白在細胞中的表現位置。㈢A 蛋白是否確如生物資訊序列分析預測結果，具有激酶功能？
申論 4細菌之抗生素抗藥性已成為醫藥領域嚴重的問題。去年在南亞發現新型超級病菌因攜帶NDM-1（New-Delhi metallo-beta-lactamase 1）所以抗藥性極強，可能藉由國際旅行進而導致全球蔓延。（20 分）㈠試說明何謂NDM-1？㈡試列舉並說明2 種可檢測細菌是否攜帶NDM-1 之生物技術方法、原理與應用。
申論 5人類基因A 所製造的蛋白質在人體中是具有催化功能的酵素（以下簡稱A 酵素）。某實驗室將攜帶完整基因A 序列的載體（vector）殖入大腸桿菌，希望能利用大腸桿菌大量表現並純化A 酵素。最後實驗結果發現純化的A 酵素喪失其催化功能。假設基因A 在大腸桿菌中的表現與A 酵素的純化過程都沒有問題，試述：（20 分）㈠造成A 酵素喪失催化功能的可能原因。㈡利用那些生物技術方法可能可以解決該問題，製造並純化具有催化功能的A 酵素？並說明該方法的原理與應用。